Noticia

La Plataforma de Biología Molecular-ACTI acaba de poner a punto el equipo “NextSeq 2000” de Illumina, adquirido con cargo a los fondos del Programa I+D+I AGROALNEXT del Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia (PRTR) financiado por la Unión Europea.

Se trata de un secuenciador masivo de alto rendimiento, con una capacidad de producción de 360 Gb totales por ensayo, pero a la vez versátil y flexible de manera que puede abarcar un número muy importante de aplicaciones entre las que destacamos:

• Secuenciación de genoma completo. Así, como referencia, el procesamiento en multiplex de 80 genomas distintos de 100 Mb cada uno arroja una cobertura media por genoma de 30x.
• Secuenciación de exoma completo.
• RNA-Seq. Por ejemplo, en experimentos de transcriptoma codificante es posible secuenciar 40 muestras conjuntamente con una profundidad de 25 millones de lecturas/muestra.
• RNA-Seq en experimentos célula única (single cell sequencing) con una capacidad de secuenciación de 20.000 lecturas/célula para 4.000 células.
• Metagenómica tipo Shotgun.
• Secuenciación de mi-ARN.