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Nuevas aplicaciones en el equipo de secuenciación masiva-NGS (Next Generation Sequencing) de alto rendimiento de la Plataforma de Biología Molecular-ACTI

La Plataforma de Biología Molecular-ACTI está en disposición de llevar a cabo nuevas aplicaciones en el equipo “NextSeq 2000” de Illumina, recientemente adquirido con cargo a los fondos del Programa I+D+I AGROALNEXT del Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia (PRTR) financiado por la Unión Europea.

Se trata de un secuenciador masivo de alto rendimiento, con una capacidad de producción de 360 Gb totales por ensayo, pero a la vez versátil y flexible de manera que puede abarcar un número muy importante de aplicaciones. Así -en el ámbito de la transcriptómica- además de los experimentos de mRNA-Seq (transcriptoma codificante), que ya se viene realizando de manera rutinaria en la plataforma, es posible desarrollar proyectos:

  • RNA-Seq de transcriptoma completo (codificante y no codificante) con una cobertura de al menos 50 millones de lectura/muestra.

Y en el campo de la epigenética:

  • “ChIP DNA sequencing”, con cobertura mínima de 25 millones de lecturas/muestra.

Los investigadores interesados en estas aplicaciones, o para cualquier duda o aclaración, pueden dirigirse a: cesar@um.es

Teléfono: 86888-8187